Село Марьино в древности называлось Марьина гора и принадлежало князьям Мышецким. В 1700 г. в нем построили деревянную церковь, освященную в честь иконы Божией Матери «Знамение». В 1728 г. по прошению нового владельца села Ивана Кирилловича Головина ветхая церковь была перестроена. В 1759 г. полковник Петр Андреевич Толстой построил в Марьине ныне существующую деревянную церковь.
В 1934 г. Знаменский храм закрыли и переделали под клуб. В 1994 г. сельская администрация возвратила храм верующим. 28 августа 1993 г., на Успеньин день, в храме возобновились богослужения. В настоящее время ведутся восстановительные работы.